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戰爭比預想中的順利。
一方面，廣西官軍孱弱，又要分兵追擊太平軍、鎮壓天地會武裝。另一方面，黑旗軍政策得力，“米飯主”、土司等地方豪強大多按兵不動，在戰爭中保持中立。
楊烜留在南寧，除了居中排程各處兵馬，也開始著手建立政府組織。
創業階段，政府應當高效統一。楊烜採取了軍政府的組織形式，對外稱為“太平天國暨南軍政府”。楊烜為軍政府首腦，稱“大元帥”。
“暨南”二字出自《尚書.禹貢》篇：“東漸於海，西被於流沙，朔南暨，聲教訖於四海。”意為面向南洋，把中華文化傳至全天下。
元帥則是華夏官職名稱。從南北朝起，元帥逐漸成為統軍征戰的官職名稱，按職權輕重、執掌分工，元帥多冠以不同名號，如天下兵馬元帥、兵馬大元帥、兵馬元帥、行軍元帥、行營元帥等，又有都元帥、元帥、副元帥之分。
到了近代，元帥逐漸成為各國最高軍銜。大元帥則成為最高統帥，譬如清末的皇帝、日本的天皇，都是法定最高統帥，稱“大元帥”。
暨南軍政府首腦為大元帥，大元帥之下為總參議。
總參議負責貫徹執行大元帥的決策指示，主持軍政府日常事務。第一任總參議，由楊烜五叔楊國琛擔任。楊國琛四十有餘，曾追隨楊遇春征戰多年，才堪大任。
總參議之下，又設若干名參議，輔助總參議管理政務。參議皆從黑旗軍中選拔，譬如步兵四團團長石達開具有相當的民政才能，得以兼任軍政府參議。
軍政府核心機構為一院、三府、八部。
一院指資政院，由若干議員組成，首長稱議長。資政院為民意機關，需定期開會，討論軍政事務。討論結果供軍政府參考，具有一定的約束力。
兩府指都察府、大理府。都察府管監察、審計、發起罪案公訴。大理府主管審判案件，具有一定的獨立性。
八部為軍政主軍事）、民政主內政）、財政主財政）、農工商主經濟）、宣教主宣傳教育）、吏主人事）、郵傳主交通、郵遞）、司法主刑獄、執行審判結果）。
總體上，暨南軍政府麻雀雖小五臟俱全。軍政府骨幹大都來自黑旗軍，為保證政權平穩過渡，亦大量留用了舊式官吏。
這天，楊烜來到資政院，參加資政院第一次集會。
在楊烜的設想裡，資政院乃是軍政府溝通人民、吸收民意的機關。為充分代表民意，資政院議員成分較為複雜，既有黑旗軍軍官，也有開明縉紳，還有舊式官僚、地方豪強。
要鎮住這些成分複雜的議員，必須為資政院選一個合適的議長。首任議長由總參議楊國琛兼任。他擔任過綠營武官，經歷豐富，是擔任資政院議長的不二人選。
軍政府初建，資政院只是一個諮詢機關，尚未引起人們的足夠重視。假以時日，資政院將發展成為議院，負責制訂法律，決定政府大項事務，成為最高權力機關。
黑旗軍進駐南寧府城後，取“左江道”衙門為總司令部駐地，是南寧最為氣派的建築。“左江道”全稱為廣西省分巡左江兵備道，轄潯州、南寧、太平三府，駐地南寧。
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按，清朝在地方上實施省、道、府、縣四級行政建制。
暨南軍政府取南寧知府衙門為駐地。資政院作為軍政府的附屬機構，辦公場地在知府衙門內一處不起眼的小院子內。
這處院子原是知府衙門“承發科”辦公的地方，現在掛上了“資政院”的牌子。舊時州縣衙門，往往設有三班六房兩科。承發科負責往來、歸檔公文，地位緊要，辦公場所稍大。
資政院首次集會，楊烜便親臨會場，足見他對資政院的重視。議長楊國琛拿來一處名單，告訴楊烜資政院主要由四部分組成：
一、黑旗軍高階軍官，如步兵四團團長石達開。石達開有撫民之才，故被總司令部派到資政院，代表黑旗軍與軍政府打交道。
二、開明縉紳，如南寧富商鄒文清。此人乃南寧數一數二的富商，思想開明，略識洋務，對楊烜舉辦工商的主張十分激賞。
三、地方豪強，如龍州司土司岑鎮南。岑鎮南為人豪爽，與黑旗軍不打不相識。他認識到了黑旗軍的潛力，黑旗軍攻入龍州時，岑鎮南也順勢投順黑旗軍。
