太平公主認為太子李隆基還很年輕，因而起初並未把太子放在心上。
不久之後，她又因懼怕太子的英明威武，轉而想要改立一位昏庸懦弱的人作太子，以便使她自己能長期保住現有的權勢地位。
於是，太平公主屢次散佈流言，聲稱“太子並非皇帝的嫡長子，因此不應當被立為太子。”
公元710年景雲元年），李旦頒下制書曉諭警告天下臣民，以平息各種流言蜚語。
太平公主還常常派人監視李隆基的所作所為，即使是一些細微之事，也要報知李旦。
此外，太平公主還在李隆基身邊安插了很多耳目，這使得李隆基心裡感到十分不安。
公元711年景雲二年），太平公主同益州長史竇懷貞等人結成朋黨，想加害於太子李隆基，便指使她的女婿邀請韋安石到自己的家中來。
韋安石堅決推辭，沒有前往。
李旦曾經秘密地召見韋安石，對他說：“聽說朝廷文武百官全都傾心歸附太子，您應當對此多加留意。”
韋安石回答：“陛下從哪裡聽到這種亡國之言呢！這一定是太平公主的主意。太子為宗廟社稷立下了大功，而且一向仁慈明智，孝順父母，友愛兄弟，這是天下人都知道的事實，希望陛下不要被讒言所迷惑。”
李旦聽過這話之後，十分驚異的道：“朕明白了，您不要再提這件事了。”
當時，太平公主正在簾子後面，偷聽他們君臣之間的談話，事後便散佈各種流言蜚語，對韋安石橫加陷害，想把他逮捕下獄，嚴加審訊，多虧了郭元振的救助，才得以倖免。
太平公主還曾乘輦車，在光範門內攔住宰相，暗示他們應當改立皇太子，在場的宰相們全都大驚失色。
宋璟大聲質問：“太子為大唐社稷立下了莫大的功勞，是宗廟社稷的主人，公主為什麼突然提出這樣的建議呢！”
於是，宋璟與姚元之秘密向李旦進言：“李成器是陛下的嫡長子，李守禮是高宗皇帝的長孫，太平公主在他倆與太子之間互相構陷，製造事端，將會使得東宮地位不穩。
請陛下將這二人外放為刺史，免去岐王李隆範和薛王李隆業所擔任的左、右羽林大將軍職務，任命他們為太子左、右衛率以事奉太子，並將太平公主與武攸暨安置到東都洛陽……”
李旦道：“朕現在已經沒有兄弟了，只有太平公主這一個妹妹，怎麼可以將她遠遠地安置到東都去呢！至於諸王，則任憑你們安排。”
於是，先頒下制命：“今後諸王、駙馬，一律不得統率禁軍，現在任職的，都必須改任其他官職。”
太平公主得知姚元之與宋璟的計謀之後，勃然大怒，並以此責備李隆基。
李隆基感到害怕，便向李旦奏稱，姚元之和宋璟，挑撥自己與姑母太平公主、兄長李成器、李守禮之間的關係，並請求對他們兩人嚴加懲處。
初九日，李旦將姚元之貶為申州刺史，將宋璟貶為楚州刺史。
十一日，李成器李守禮被任命為刺史的事，也停止執行。
公元712年延和元年），太平公主指使一個懂天文曆法的人，向李旦進言：“彗星的出現，標誌著將要除舊佈新，再說位於天市垣內的帝座以及心前星均有變化，所主之事是皇太子應當登基即位。”
李旦道：“將帝位傳給有德之人，以避免災禍，我的決心已定。”
太平公主和她的同夥們，都極力諫阻，認為這樣做不行。
李旦道：“中宗皇帝在位時，一佞小人專擅朝政，上天屢次用災異來表示警告。朕當時請求中宗選擇賢明的兒子立為皇帝，以避免災禍，但中宗很不高興。
朕也因此而擔憂恐懼，以至於幾天吃不下飯。朕怎麼能夠對中宗可以勸他禪位，對自己卻不能做到這一點呢！”
於是，他在八月傳位太子李隆基，自己退為太上皇，改元先天。
同年，太平公主的丈夫武攸暨去世。
公元713年先天二年），太平公主倚仗太上皇的勢力，專擅朝政，與李隆基發生尖銳的衝突，朝中七位宰相之中，有五位是出自她的門下，文臣武將之中也有一半以上的人依附她。
