兩人暫時聯手對付這個boss。
中途，a2告訴9s：
這座塔其實是一個發射臺，用火箭來摧毀月球的人類伺服器。
除此之外，她還告訴9s，2b其實是“e型”，是專門殺死同伴的部隊。
一開始2b出現在9s身邊，就是為消滅所有證據而存在的。
換言之，2b存在的目的，就是要殺死9s。
9s知曉了一切真相，不過他也不在乎了——他只想摧毀這世界上的所有。
這時候玩家可以選擇操縱9s或者a2，分別對應不同的結局。
選a2的話，她很快擊倒了9s，並黑進他的意識中.
原本9s的感染程度已經達到無可挽回的地步，但a2將所有病毒都集中在自己身上，恢復了9s的生命。
她命令pot將9s和一個2b的複製體帶走。
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她自己則成功摧毀了整座白色高塔，並葬身其中。
如果選9s的話，在戰鬥過程中，a2會因為聽到2b的呼喚而分心。
9s趁機用劍刺穿了她，但他自己也死在了2b的劍上。
在他的彌留之際，白色高塔內的火箭發射升空，摧毀了月球……
這時候，上官言的視線陷入漆黑之中，隱約能看見閃爍的光點，就像夜空一樣。
在空靈婉轉的歌聲中，他陷入了沉思。
雖然這裡面的各種科技，還有人工智慧和機械生命體的設定，讓他有點迷茫。
但整個故事的劇情卻讓他感到深深的震撼。
在他之前玩的遊戲中，只要通關一週目後，基本上知道了九成以上的劇情。
然而，在尼爾中，一週目最多瞭解劇情的三到四成。
在二週目中，很多東西都被顛覆，敵人也會展露自己的真實面貌。
到了三週目，整個劇情再次被顛覆，不光主角們淪為棄子，就連他們為之戰鬥的東西都不再存在。
對於上官言來說，這是從未有過的體驗。
“滋~嚓~”
突然，周圍再次出現機械運轉的聲響。
pot042和pot153出現在畫面中。
它倆需要對a2、9s、2b的資料進行刪除。
不過，在這個過程中，042表示無法接受這個結局。
它拒絕刪除資料。
同樣的，153心裡其實也不認可這個結局。
它倆商量之後，向玩家提出一個問題：
【你希望他們都活著嗎？是否】
上官言毫不猶豫地選則了“是”——他當然希望主角們都活下來。
這時候，畫面切換，他再次進入彈幕射擊模式。
為了改寫結局，他必須控制一架小飛機消滅所有敵人。
那些敵人都是奇怪的字元，上官言都不認識。
在尼爾原作中，這些字元都是遊戲製作組員工的名字。
