聽說楊烜提前來到學堂視察，校長何寅只得匆匆結束課程，前去迎接楊烜。
何寅是廣東肇慶人，也是海軍司令陸雨晨的好友。他年輕時曾在南洋師從英國傳教士馬禮遜，於肇慶之戰時追隨楊烜，是個非常難得的西學人才。
副校長正陪著楊烜，在會議室裡講解新修改的學堂章程。大學堂已經建立了大半年時間，遇到了不少矛盾問題。這次修改章程，就是想解決這些矛盾問題，進一步推動大學堂的發展。
何寅來時，楊烜已經基本審定了新的學堂章程。何寅便簡要介紹了此次學堂改革所遵循的原則：
一、實施集體民主。
校長由大元帥提名，經教授委員會批准，方得上任。教授委員會顧名思義，委員均從各學科教授中評選，員額不定，在十幾人不等。教授委員會主任，由校長兼任。
但凡人事任命、教授選聘、學位授予、學科增減、經費開支等大事，都由教授委員會集體決定。
校董會主要負責一般性行政事務，接受教授委員會領導。
二、建立學位認證、教授評議制度。
暨南大學堂設立文、理、工、法、醫、農六個學院，學制三年。
學生畢業時，需提交一篇論文，經學位評定委員會認定透過後，方得授予相應的學位。
實行導師負責制，每個教授都負責幫帶若干個學生，每個學生都有對應的導師。
教授的選聘、晉升由教授委員會自主決定，其他人不得干預。
每個教授需定期接受教授委員會的考核、稽查，督促教授們盡心用命，及時清理濫竽充數之徒。
不難看出，新修改的章程變動很大，極大的提高了教授的地位。何寅本來有些忐忑，擔心楊烜不會批准新章程。
但楊烜深知學術自由的重要性。如今科技日新月異，洋人的科技又已遙遙領先。華夏想要後來居上，必須尊崇學術科技，大幅提高教授的地位。
楊烜爽快地說道：“學術自由本就是大學的應有之義。大學堂要修改章程，我完全同意。不過，我也有一些建議，供何校長斟酌。
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“暨南大學堂是軍政府治下唯一一所綜合大學，今後將長期作為軍政府最高學府。因此，你們要著眼長遠，開展理論性、基礎性、前沿性研究。
“譬如，西方已經開始研究應用石油、橡膠、電力等新技術。雖然暨南大學堂偏居廣西內陸，也應未雨綢繆，開展相應的研究。”
楊烜同意學校由教授自治，何寅自然要投桃報李，說道：“大元帥如此厚愛，我們學堂全體師生也要知恩圖報，不負大元帥的殷切希望。”
辦新式大學堂，自然需要籌集大量經費。上一次，伍菡帶來三十萬兩白銀私房錢，楊烜在教育上用去十萬兩，僅暨南大學堂一家，就分得兩萬兩白銀。
歷史上，曾國藩創辦湘軍水師，總共才花了四萬兩白銀，可見白銀的購買力。
這兩萬兩白銀看似很多，其實遠遠不夠。大學堂要開展科學研究、創辦新式課程，與曾國藩創辦內河水師截然不同，是一件極為燒錢的事。
暨南大學堂的經費很大一部分來自富紳的捐助、富裕學生的學費。當然，並非每個富紳都很無私，很多捐助都是有償的：富紳捐一大筆錢，讓兒子得以入讀大學堂。
吸收富紳捐款，原本反對聲音很大。楊烜受“清末新政”啟發，力排眾議，允許暨南大學堂從富紳捐款中籌集經費。
1901年，在慈禧太后的默許下，清政府進行改革。改革內容與1898年的戊戌變法近似，但更廣更深，還廢除了千年仕宦之道的科舉制度。
這就是中國近代史上大名鼎鼎的清末新政。但彼時中央權威已墮，地方督撫作大，清廷已經無力在全國推行新政，很多新政措施無疾而終。
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然而，在教育方面，清末新政可謂成果斐然，不僅廢除了科舉制度，還興辦了許多新式學校。
後世鍵盤俠們常說清廷廢除科舉，革了自己的命。實際上，廢除科舉在全國很受支援，各地督撫落實教育改革也都十分踴躍。
