新官上任三把火。升任至臻堂堂主後，楊烜第一件事便是整頓隊伍，把至臻堂改造為一支新式軍隊。
至臻堂上下瀰漫著濃重的江湖習氣，內部組織較為鬆散。老堂主生前熱衷於煙土生意，普通會眾上行下效，缺少紀律意識，更沒有戰鬥血性。
據初步統計，至臻堂有一半以上的會員為破產農民，其餘多為破產運輸工人、船民、水手、散兵遊勇、商販、僱工等。
這些人加入至臻堂，主要是為了尋求經濟上的幫助，即“混口飯吃”。入會時，需舉行歃血結拜、血盟誓約等儀式，形成虛擬的血緣關係。
老堂主殷正讀過書，在控制會員上另有一套。他深知“有奶變是娘”的道理，極力維持煙土生意。有了錢，他便能廣為施捨，結交官府，在經濟上控制會眾。
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除此之外，至臻堂與別的天地會山堂並無區別，同樣的組織渙散，同樣的胸無大志。
楊烜剛作至臻堂堂主，手下的隊伍還很孱弱，不能旗幟鮮明地打出反清旗號。但是，大刀闊斧地改組至臻堂，把它改造成一支新式軍隊，卻是可行的，也是迫在眉睫的。
興建新式軍隊，第一件事便是確立軍隊編制。
當時的華夏軍隊，不管是八旗還是綠營，都已不能適應新的軍事形勢。
對內，八旗綠營不能鎮壓民變，被日後的太平軍、捻軍打得落花流水。對外，八旗綠營更是不能抵禦外敵，被洋人打得毫無還手之力。
1853年，曾國藩建立湘軍，開創漢人獨立掌軍的先河。湘軍最終鎮壓太平軍，深刻地影響了華夏近代史的走向。
楊烜並不想模仿湘軍，他把眼光瞄得更高，準備模仿西方軍隊模式，興建一支新式陸軍。
當時，名聲最大的西方陸軍，應當是英國陸軍。英國國力世界第一，陸軍“線列步兵戰術”獨步天下，能將射擊精度控制在一秒鐘之內。
但楊烜知道，最精銳的西方陸軍，應當是普魯士軍隊。此時德國尚未統一，德意志聯邦四分五裂。普魯士周圍強敵環伺，與法國、奧地利、丹麥等強國接壤。
憑藉著銳不可當的陸軍，普魯士接連打敗奧地利、丹麥、法國等鄰國，最終統一了德國，成為歐洲大陸上首屈一指的大國。
十九世紀中頁，西方列強陸軍最大編制單位大多為團。普魯士軍隊的最大編制單位已經編到了軍，其軍事前瞻性可見一斑。
楊烜要興建新式軍隊，就要提高站位，以普魯士軍隊為模板，全面向普魯士軍隊看齊。
軍隊的名字，暫時定名為“黑旗軍”。之所以取名為黑旗軍，有兩層意思。
其一，楊烜的祖父楊遇春每戰必張黑旗，所部稱“黑旗楊家軍”。
楊遇春為名將，門生故吏遍佈天下。譬如湖南提督向榮，被楊遇春拔於卒伍之間，目前正在廣西圍剿天地會起義軍。
將所部命為“黑旗軍”，可以博得時人的同情，爭取楊遇春舊部的支援。
其二，天地會起義軍遍佈兩廣，派系甚多，也有稱“黑旗軍”、“花旗軍”的。楊烜稱所部為“黑旗軍”，可以混淆視聽，避免樹大招風。、
從此之後，廢絀天地會至臻堂的稱號，改以“黑旗軍”稱之。
黑旗軍模仿普魯士陸軍的編制，暫時編為一個步兵團。首長稱司令，自然為楊烜，副司令為至臻堂的二把手薛昊。
但是，華夏又有著自己的國情。在司令部的設定上，楊烜並不盲目照抄普魯士陸軍編制，另有創新。
黑旗軍設司令部，以楊烜為首長，下設參謀處、軍政處、後勤處三大機關。
參謀處主指揮打仗，下設作戰科、偵察科、軍法科、通訊科等部門。首長稱參旗長，首任參謀長為馮可欽。
軍政處下設人事科、宣傳科、教育科、紀檢科等部門。最高首長稱主任，楊烜兼任軍政處主任。
後勤處下設軍需科、軍械科、彈藥科等部門。首長稱處長，副團長薛昊兼任後勤處長。
華夏傳統軍隊大多在部隊之外設營務處、糧臺兩大機關。營務處相當於部隊參謀機關，糧臺相當於後勤機關，負責為部隊供應糧餉。
黑旗軍的司令部額外增加一個人事機關，把指揮、人事、後勤機關統歸在一起，以便最大限度地提高效率。
司令部以下，有營、連、排、班四級編制。其中，班有十人，由班長統之。排有三十人，由排長統之。連有一百二十人，由連長統之。營有五百人，由營長統之。
大致上，每級部隊下轄三個主力分隊。譬如，一個步兵團下轄三個步兵營，一營下轄三連，一連下轄三班。
班為最低一級編制單位。班長由士兵擔任，稱士官。排長以上始為軍官。
黑旗軍暫編一個步兵團，下轄近衛連、騎兵連、火器營、工兵連、一營、二營、三營、水營，另有斥候、軍醫等少量直屬部隊。
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