接下來，隆慶帝開始為司馬清正講解朝中的局勢，以及各個朝臣的來歷以及身份背景，賢寧皇後則在一旁加以補充。
從第二日開始，司馬清正便易容成隆慶帝的模樣，開始上朝聽政。
因著司馬清正已離開京城多年，朝中大小官員的臉孔對司馬清正來說，都是非常陌生的，幸好福全已跟隨隆慶帝身後上朝多年，對朝中形勢非常清楚，可以在一旁提點司馬清正。
上朝之後，福全按照從左到右的佇列順序，一一介紹了官員們的姓名，司馬清正再與昨日隆慶帝告之司馬清正的有關他們的官職和關系背景等一一對上，暗暗記在心中，並對他們進行逐一觀察。
回到隆慶帝的住處之後，隆慶帝將當日所收上面的奏摺也直接交由司馬清正處理，他僅僅是在司馬清正批完之後，審閱一下，給點意見而已。
幾日下來，司馬清正處理朝政變得越來越順手。
透過朝堂上的言語以及奏摺上的文字，司馬清正也大概對大臣們的性格有了一個大致瞭解，知道哪些人狡詐奸猾，哪些人憨厚忠誠，哪些人可重用，哪些人不堪大任，等等。
而在這些人之中，司馬清正最討厭的便是那個倚老賣老的秦丞相，不知是不是從秦皇嫂處得知了司馬清明的病情，他想讓宗義和宗強兄弟上朝聽政的要求變得越來越迫切，不過每次均被司馬清正用四兩撥千斤的方法打壓了過去。
不僅如此，為了防止日後外戚專權，司馬清正直接將宗義和宗強從司馬清正原本的太子人選候選名單中勾了去。
只是，說到司馬清明，司馬清正不禁又開始傷感起來，接手朝政後，司馬清正曾有幾次夜裡出宮去看望他。
不過，每次回宮後，司馬清正都會難過上半天，因為司馬清正只能眼睜睜看著司馬清明生命力一點點的衰竭，卻無能為力。
而之所以將探視時間選在晚上，卻是司馬清正故意而為之，不僅僅是因著司馬清正政務繁忙，還因為司馬清正怕白日裡會碰上被司馬清正安排在公主府照顧司馬清明的風嫵，司馬清正不知道該怎樣向她解釋自己現在的處境，也不知道自己能不能如曾經向她承諾過的那般，遠離京城，遠離世事，與她一起，光明正大、自由自在的生活。
除此之外，司馬清正還可以在探視完司馬清明之後，趁著月黑風高，潛去尚書府，在她房間的屋頂上，揭開幾片瓦，呆呆的打量上她一陣，以慰自己的相思之苦。
然而，即便是這樣，這種日子也沒有持續太久。
司馬清正篇 49
隆慶三十二年十月十五日晚上，察覺到司馬清明已到了強弩之末的風嫵，讓司馬宗仁派人分別去皇宮通知司馬清正、隆慶帝、賢寧皇後以及宗義、宗強、秦皇嫂他們來看看司馬清明。
果然，呈迴光返照之勢的司馬清明對在場的每個人都好好囑咐了一番後，終於不堪病痛的折磨，拋下他的妻兒、隆慶帝、賢寧皇後以及司馬清正，撒手人寰。
當時，風嫵也在場，看著悲痛欲絕的司馬清正，曾欲上前安慰一番。
一來心情確實糟糕到了極點，二來也不知道該與她說些什麼，所以，司馬清正只是匆匆的對她點了個頭，就去安慰隆慶帝和賢寧皇後去了。
之後的幾日，司馬清正抵擋住來自秦丞相和秦皇嫂方面的壓力，依照司馬清明臨終前要求，準了司馬宗仁所上的奏摺，從雲雀境地運來雲雀皇嫂屍骸，與司馬清明一起合葬在皇陵，按照帝王葬禮的規制來舉辦。
而辦完司馬清明的身後事之後，隆慶帝第一次不顧司馬清正的意願，親自下旨，冊封司馬清正為太子，以便日後能以太子身份，用司馬清正的真實面目來上朝聽政，也好伺機建立司馬清正的威信。
不忍心惹因喪子之痛再次讓身體變得搖搖欲墜的隆慶帝生氣和傷心，司馬清正抱著僥幸心理，想等到隆慶帝身體好點之後，再來說服他同意司馬清正將太子之位禪讓給司馬宗仁。
選擇司馬宗仁，是因為他即位不會如宗義、宗強那般造成外戚專權，而且，他生性純良，應當也不會過分的為難宗義、宗強以及秦皇嫂。同時，也能讓司馬清正解脫出來，不會被皇位所羈絆。
因此，司馬清正開始有針對性的培養成司馬宗仁來。
只是，隆慶帝並未給司馬清正時間，讓司馬清正為自己的禪位做準備，隆慶三十二年十月三十日淩晨，他也撒手西歸，去天上尋找司馬清明去了。
自然，在他的那道臨終遺旨上，皇位繼承人毫無疑問就是司馬清正了。
司馬清正懷著沉痛無比的心情，處理完隆慶帝的喪事，又為了不引起政局的動蕩，於隆慶三十二年十一月三日登基，改年號為清正元年。
只是，司馬清正登基後第一件事，便是追封司馬清明為“威強敵德帝”，雲雀皇嫂為“柔質慈民曰惠皇後”，秦皇嫂為“溫柔好樂曰康皇後”。
既然司馬清正將司馬清明追封為帝，那便也能順理成章的冊封司馬宗仁為皇太子，宗義為平南王，宗強為平西王，打算再輔佐司馬宗仁一兩年，便將皇位禪讓與他。
只是，這道聖旨尚未發出，便被以前服侍賢寧皇太後，現在改服侍司馬清正的舊宮人偷偷告之了賢寧皇太後，知曉司馬清正有意圖將帝位傳給司馬宗仁的賢寧太皇後迅速趕到司馬清正面前，阻止司馬清正冊封司馬宗仁為皇太子。
她說司馬清正登基為帝，朝中官員或許驚訝，但卻也挑不出什麼理來，因著司馬清正畢竟是嫡皇子，司馬清明過世，由司馬清正來繼承皇位本也是無可厚非之事。
司馬清正篇 50
然而，司馬清正若冊封司馬宗仁為太子則大大的不妥，因為冊封太子或繼承皇位無非是三種情況，一是立嫡，一是立長，一是立賢。而司馬宗仁既非嫡子，又非長子，他的賢能也還未能展現於人前。
到時聖旨一下，必會激起秦相一派官員的不服和抗議。雖然秦相為人霸道，但是，他在朝中的根基和影響力不容小窺。司馬清正離京多年，並未在朝中擁有屬於自己的勢力，而且又是剛剛登基，實在不宜如此正面與秦相為敵。
其實，賢寧皇太後說的這些司馬清正又何嘗不明白呢？只是，只有禪位與司馬宗仁，司馬清正才有與風嫵繼續的可能性，否則，司馬清正便不得不放棄她了。
