荷蘭人的艦隊也沒能被鄭成功徹底封鎖，第一時間就有護衛艦熘回去報信求援了，這也是荷蘭人的信心所在。
既然如此，那就只能慢慢圍城強攻了。
明軍後續船隊，陸續把張名振的重型火炮，尤其是開花彈攻城臼炮都逐步運上了岸，部署到位。
明軍攻城臼炮的最大射程，也明顯超過了這個時代的荷蘭人要塞炮，誰讓明軍的鍊鋼技術和火炮技術，已經超越了荷蘭呢。
雖然正常情況下，同一個時代的要塞炮射程都會遠於艦炮、野戰炮，但奈何明軍最新式重炮和荷蘭要塞炮，已經不是同一代產物了。
鄭成功和張名振試探性攻打了幾日後，也逐步摸清了被分割包圍的荷軍各據點守軍實力強弱，兩人一合計，就決定各個擊破，先挑軟柿子捏，爭取捏爆的過程中，也能震懾住相對硬柿子城池裡的守軍，讓他們選擇直接投降。
既然如此，熱蘭遮城位於臺江口大員灣南岸的丘陵上，地勢相對較高，城池也最堅固，守軍人數和大炮最多，那就最後再打。
赤嵌城在海灣腹地相對平坦的地區，人數也少一半，要塞炮沒法居高臨下彌補射程優勢，那就讓明軍攻城臼炮充分發揮射程差慢慢推好了。
在明軍火炮的圍轟下，進攻還算順利，雖然近似17世紀新式西方稜堡的堅固程度很高，幾天才轟開一些小坍塌，但畢竟是放風箏白嫖的傷害。
假以時日，赤嵌城陷落是必然的。城內的守軍也有試圖組織夜襲、破壞明軍炮兵陣地，但都失敗了，還白白折損了敢死隊。
600多人的赤嵌城，被圍攻了一個多月後，還剩400號人和若干平民，終於因為絕望而選擇了投降——
實際上荷蘭人的陣亡數，當然遠不止200多，因為這200多隻是正規軍士兵的陣亡，而城內的水手商人碼頭工人，戰時也都會拿著槍上城助守的，這部分人也有不下於此數的傷亡。
這時代敢來遠東謀生計的荷蘭人，幾乎個個是亡命徒，就算不當兵，也民風彪悍。
拿下赤嵌城後，張名振還覺得這個攻擊速度有點太慢了，
但實際上他要是知道平行時空的歷史上、鄭成功強攻各處荷蘭要塞花了多久，就不會這麼覺得了。
張名振和鄭成功再次合計，確認這個戰術是沒問題的，但長期消耗那麼多部隊圍攻，實在是有些軍糧補給不上。
這時代的大員島土著人口數量也不多，島嶼東岸中部還有一個叫大肚王國的土著人國家，比較排外。此前肯跟大明王師貿易賣糧補給軍需的，不過是島南當地的少數土著而已。
要長期越海維持三萬大軍的軍糧，從福建那邊把一切所需物資運過來，成本就太高了，運輸壓力非常大——
在鄭家，如今鄭成功也不是完全能話事，他父親鄭芝龍還活著，產業經營和商貿運輸，都捏在鄭芝龍手裡，鄭芝龍表示壓力太大，張名振也沒法查賬。
考慮到步兵部隊只要最後攻堅掃尾、加上包圍住城池防止荷蘭人出城反衝炮兵陣地，後續階段還真用不了那麼多人。
雙方一合計後，終於做出了一些妥協，張名振只留下少數炮兵部隊，其餘北方明軍問題，再回南京請示了朱樹人後，允許暫時撤回。
鄭家的出兵，也從兩萬五千人酌情減少一部分，或許會減到一萬五，用於長期圍城攻堅和保護炮兵。
與此同時，鄭芝龍還透過鄭成功給朱樹人下了軍令狀，保證即使張名振大部分人撤走，只要留下攻城重炮隊，鄭家就一定最終拿下全島。
張名振和鄭家一部分兵力撤回北歸的時候，就順路花了個把月時間，走走停停，滅了東岸中部的大肚王國，一個高山土著人國家，沒什麼好說的。
隨後途經澹水，又滅了澹水的安東尼堡守軍，把島北荷蘭人主力肅清。安東尼堡是兩年前被摧毀的西班牙人聖多明各堡重修而來的，如今還沒修完，破破爛爛的，所以在明軍火炮下很容易攻破。守軍的五個不滿編連隊800多人，被擊殺了一小半，其餘也都投降被俘。
到了臘月底，開戰整整兩個多月後，線尾嶼炮臺、赤嵌城、安東尼堡三處都已經告破，大肚王國也滅國了，
全島唯一抗拒大明的，只有一座熱蘭遮城，撐到了隆武三年新年。
……
張名振把大部分朝廷嫡系軍隊撤走後，只留了一個負責攻城炮兵隊的參將張國柱協助鄭成功。
鄭芝龍得知了這一情況，才親自帶了一些船隊，趕來大員島，跟兒子私下裡見面了。
鄭芝龍這廝也是有野心的，立刻跟忠義的鄭成功交代了一些事情：可以少量部隊圍住熱蘭遮城，然後在周邊屯田，把被荷蘭人堅壁清野的田地重新種起來，而且要擴大開荒，逐步實現攻城部隊的軍糧自給自足。
大員島南部的臺江平原，還是挺肥沃適合大面積種稻米的，後世也能產出大量糧食，足夠當地人吃還有餘，能往北方的澹水販運。
