故皇太極要採取的是進攻戰略。
但皇太極的決定卻遭到貝勒們的反對；故後金統治集團內部戰略思想出現爭議。
皇太極是透過盛京君臣大討論，對明、蒙、朝三大敵方勢力進行戰略判斷，並及時地對原有判斷作出調整。
皇太極最終戰略目標是明朝，攻明戰略是指導戰爭全域性的原則性、綱領性任務。
但貝勒們的“共識”中'有一個“隱患”，就是太過輕鬆地估計了對明作戰；沒有深刻地考慮到對明作戰的曠日持久；這一點只有皇太極有思想準備。
在總的戰略之中，根據戰局發展，突然派兵征伐李倧，解決後顧之憂。
而從天聰年間起，四次入關征明，也證實了要滅明是需要一些時間的。
這正如皇太極的伐大木理論所言：取燕京如伐大樹，需要從兩旁斫削，則大樹自僕。
明朝雖已腐朽不堪，但作為一株百年大樹，尚未達到自僕的程度。
而先解決李氏政權這個後顧之憂，無疑會為後金增加新的人力、物力；更重要的是沒有了後顧之憂。
而後崇德年間迫使李氏政權臣服，確實證實了皇太極這一戰略思想的正確。
皇太極從天助神佑的天命觀出發，強調“用兵征伐，有道者，蒙天佑；無道者，被天譴”。
皇太極認為自恃其力，恣行殺奪，人心未合，必然失敗；力行仁義，勤治農桑，發展經濟，擴充實力，爭取民心，就能立於不敗之地。積極發展軍事力量，先後組建蒙古八旗、漢軍八旗，完善了八旗兵制。
要求部隊嚴格訓練，“操演嫻熟”。
在保持和發展八旗兵騎射長技的同時，重視採用先進的軍事技術，利用漢人工匠製造紅衣炮，組建炮兵部隊，增強戰鬥力。
治國治軍，主張以人才為本，不論民族、資歷，惟才是用。
以“滿漢一體”為號召，爭取漢人支援，重用漢人降臣降將，以漢治漢。繼承努爾哈赤“伐大木”的戰略思想，並根據後金“家邦未固”、“四境逼處，素皆不協”的內外形勢，進一步確定了先征服弱小之敵，拆散敵人之間的聯盟，解除後顧之憂，爾後集中力量攻擊強敵，統一天下的戰略方針。
改變努爾哈赤單純依賴武力連續攻明的戰略，採取講和與自固的靈活政策，以達到麻痺敵人，爭取民心，贏得時間，壯大自己的目的。
皇太極五次派兵避開明朝堅固的正面防線，繞道入關，深入京畿，不斷削弱明朝實力，改變了雙方力量對比，為最後決戰的勝利創造了條件。
在作戰上，皇太極善於根據不同的作戰物件，採取不同的戰法和策略。
大軍壓境，速戰速決；掘壕築牆，久困長圍，圍點打援；武力征討與政治招撫相結合，成功地指導了對朝鮮、漠南蒙古和明朝的戰爭。
皇太極的軍事思想，吸收了中原漢族軍事文化，豐富和發展了滿族的軍事思想，在清代前期有重大影響。
比起韋寶這個真正的重生穿越巨，皇太極也很像是一個穿越來的人，他總是能保持冷靜的頭腦，很少犯錯。
“聰古倫，我來告訴你為什麼不能向韋寶求救。先不說我們與寶軍的仇恨，單說寶軍，與明軍是不同的，我們可以和大明暫時議和，但絕不能與寶軍議和！因為大明大，在他們眼中，我們大金國是很小的，小的像是一股山賊！而在寶軍眼裡，我們是兩顆並肩長成的大樹，不管是他的壯大，還是我們的壯大，都一定會對對方有很大的影響，所以，我們不可能與寶軍議和。”皇太極道。
“可父汗的病怎麼辦？難道父汗對我大金國不重要嗎？”聰古倫格格生氣道。聰古倫實在想不到，居然是皇太極帶頭反對向寶軍求救。
莽古爾泰道：“我也不贊同向寶軍求藥，但我曾經被寶軍俘虜過，我不得不說，寶軍的藥是有效的，很神奇，我上回受了很重的槍傷，還有之前的毒疽之毒，寶軍不用數日，幫我一併治好了，我原本還以為我肯定死定了。”
眾人都對莽古爾泰的話很疑惑，都暗忖，你這到底是讓向寶軍求藥，還是不讓向寶軍求藥？
“父汗的傷勢要緊，現在到了危機關頭，也顧不上這麼多了，還是大家舉手議事吧！”代善這時候少有的露出決斷，舉手道：“贊同向寶軍求藥的舉手！”
在場的建奴將領們互相看了看，都很遲疑。
除了代善，只有聰古倫格格立刻舉手跟隨，此外還有幾名年幼的貝子。
莽古爾泰猶豫了一會兒之後，舉手了。
莽古爾泰這一下舉手至關重要，立刻有多名將領跟著舉手。
這一下，舉手的人和不舉手的人就看上去差不多了，目測很難分出哪一邊人多，哪一邊人少。
