這種藥雖然研製出來了，卻有很大的隱患。
一旦服藥者的體質和aptx4869的成分不相符，就無法獲得返老還童的機會，甚至會搭上自己的性命。
x先生自然不會拿自己的性命冒險。
所以他讓宮野志保去完善aptx4869這種藥，把aptx4869和自己的基因結合在一起，形成獨屬於x先生的藥物。
誰知道宮野志保早就不滿於黑衣組織對她的壓迫，於是宮野志保不但沒有按照x先生說的做，反而自己冒險吃下aptx4869，然後逃生。
x先生知道宮野志保離開以後，就讓自己的心腹，也是組織裡最有實力的琴酒去追，琴酒追回了宮野志保研製的所有成品aptx4869，但是讓宮野志保逃了，還陰差陽錯的讓工藤新一把aptx4869吃了下去。
不單單如此——
工藤新一還極其巧合的就是和aptx4869基因匹配的那個人。
工藤新一吃下aptx4869後，不但沒有死去，反而意外的返老還童。
而且，逃跑後的宮野志保和工藤新一竟然意外結成同盟，並且還和黑衣組織中的臥底——
安室透和赤井秀一兩個人聯絡上了。
這些人一起結成了打擊黑衣組織的同盟。
琴酒作為黑衣組織的代表，自然和這些人開始作對。
工藤新一，這位擁有著超凡智慧與無畏勇氣的高中生偵探，在偶然間撞破了琴酒所率領的黑衣組織那不可告人的罪惡勾當後，便毅然決然地踏上了與之對抗的艱難征程。
工藤新一深知，這個組織的存在猶如一顆毒瘤，侵蝕著社會的每一寸肌膚，若不將其拔除，無數無辜的生命將繼續遭受荼毒。
與此同時，身為日本公安精英的安室透，憑藉著對正義的執著堅守以及在情報領域的深厚造詣，早已秘密潛伏進黑衣組織內部，如同一顆深埋的定時炸／彈，等待著最佳的引爆時機。
而赤井秀一，這位fbi 王牌特工，冷峻堅毅的外表下藏著一顆熾熱的心，他以精準的槍法和過人的謀略，成為了黑衣組織最為忌憚的對手之一。
三人憑藉著各自獨特的優勢與資源，如同三條緊密交織的繩索，聯結起了日本警方、cia、fbi 以及形形色色的官方組織。
他們對琴酒帶領的黑衣組織展開了一場全方位、無死角的圍追堵截。
隨著時間的推移，各方的情報如雪花般在各個組織之間紛飛傳遞，每一次的線索交接都伴隨著緊張的低語與凝重的眼神。
警方們穿梭在城市的大街小巷，嚴密監控著可疑人員的一舉一動；特工們則憑藉著先進的裝備與精湛的技能，深入虎xue，探尋著黑衣組織的核心機密。
琴酒這邊，作為黑衣組織的核心骨幹，他冷酷無情，手段狠辣，指揮著麾下的一眾手下，與工藤新一等人展開了一場驚心動魄的生死博弈。
在那一次次的交鋒中，雙方鬥智鬥勇，你來我往，互不相讓。有時，黑衣組織憑藉著對地下世界規則的熟稔，巧妙地擺脫了追蹤；而有時，工藤新一等人又憑藉著智慧的光芒，識破了敵人的陰謀詭計，給予對方沉重一擊。
局勢如同一盤變幻莫測的棋局，每一步落子都充滿了變數。
然而，就在兩方僵持不下、陷入膠著狀態之時，一個更為神秘、更為危險的組織——“動物園”，宛如一條隱藏在暗處的毒蛇，悄然露出了獠牙。他們趁著黑衣組織與工藤新一團隊爭鬥正酣，注意力全被分散之際，發動了一場出其不意的閃電襲擊，目標直指正被戰火籠罩的黑衣組織總部。
那是一個月黑風高的夜晚，黑衣組織總部燈火通明，成員們正全神貫注地應對著來自工藤新一等人的壓力。
突然，一陣劇烈的爆／炸聲打破了夜的寂靜，火光沖天而起，將整個總部照得如同白晝。
“動物園”組織的成員們如鬼魅般從四面八方湧現，他們身著統一的黑色作戰服，臉上戴著猙獰的面具，手持精良的武器，向著毫無防備的黑衣組織成員展開了瘋狂的屠殺。
琴酒聽到爆／炸聲，臉色瞬間變得鐵青，他猛地站起身來，手中緊握著那把標誌性的手／槍，眼神中透露出前所未有的憤怒與震驚。
“怎麼回事？！”他怒吼道，聲音如同雷霆般在總部大樓內回蕩。還沒等他得到回應，一群“動物園”組織的敵人已經沖了進來，他來不及多想，抬手便是幾／槍，精準地擊倒了沖在前面的幾個敵人。
而此時，在城市的另一個角落，工藤新一、安室透和赤井秀一等人也察覺到了異樣。
他們透過情報網路得知了黑衣組織總部遭受襲擊的訊息，三人對視一眼，眼中都閃過一絲疑惑與警惕。“這是怎麼回事？難道還有第三方勢力？”
工藤新一皺著眉頭，低聲說道。
