東輝海軍特種作戰司令部下轄：
第九艦隊司令部，負責執行全球特種作戰和兩棲攻擊任務，總部計劃設在印尼的蘇門答臘。
東輝海軍電子戰司令部和補給司令部，總部設在天堂島。
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此外，程功還專門設定了一個東輝海軍司令部，所有九支艦隊的職能司令部水面、航空兵、潛艇)均在海軍司令部內實施合併，但實際運作方面可以保持獨立指揮。
增大了地勤人員編制，並設立了內河流域巡邏部隊，組建海軍遠征作戰司令部，把海軍建制內所有地面力量集中在一個完整的指揮體系下。
海軍遠征作戰司令部包括海軍工兵、軍械爆破·處理、海軍憲兵、打撈單位和內河巡邏隊。
計劃組建十一個航母打擊戰鬥)群，一個遠征打擊兩棲攻擊群。
遠征打擊兩棲攻擊群在兩棲攻擊艦編隊內增加攻擊型核潛艇和國王級戰列艦，提高對地攻擊火力和反潛能力。
新建九艘彈道導彈核潛艇ssbn）和九艘巡航導彈核潛艇ssgn）。
ssgn一次可攜帶154枚巡航導彈或50名特種作戰人員，以提高對地攻擊及瀕海作戰能力。
戰術航空力量開始從f4“鬼怪”向f14“雄貓”過渡。
程功沒打算建立獨立的陸軍，而是組建一支龐大的海軍陸戰隊。
東輝海軍陸戰隊由地面部隊、航空兵和後勤部隊三部分組成，是東輝快速反應部隊的主要作戰力量。
海軍陸戰隊主要有四個陸戰師、四個陸戰航空兵聯隊和四個勤務支援大隊組成，另外還有一個陸戰師、一個陸戰航空兵聯隊和一個勤務支援大隊為預備役部隊。
按程功的計劃，海軍陸戰隊採用的是混合編組方式，主要編為四個陸戰遠征部隊、一個預備役部隊、六個陸戰遠征分隊及若干特種任務小隊等空地聯合特勤部隊。
陸戰隊遠征打擊部隊是空地聯合特遣部隊中規模最大的任務編組部隊，主要包括一個加強陸戰師、一個陸戰航空兵聯隊配有416架戰鬥機、運輸機、預警機和無人機)和一個勤務支援大隊，總兵力為六萬人左右，正常情況下將由一名中將指揮。
東輝海軍陸戰隊空騎第一師，隸屬東輝海軍陸戰隊第一遠征部隊，駐紮在天堂島海軍基地，是東輝海軍陸戰隊主力師和東輝國家武裝力量戰略機動部隊。
騎一師滿編為二萬人，下轄第1、第5、第7陸戰步兵團每團各轄一個司令部營和三個步兵營)和第14陸戰炮兵團轄四個炮兵營)，以及第23陸航團2個攻擊直升機營、1個航空指揮連、1個陸航中隊），另外還有七個師屬營連司令部營、第一直升機偵察營、第一戰鬥工兵營、第一陸航中隊、第一警通營、第一防化連、第一憲兵連)
全師主要裝備有：
米28攻擊直升機348架，米24攻擊直升機238架，v22運輸機308架，v22指揮型直升機167架，ad1攻擊機36架，a10攻擊機8架，ac130u多用途炮艇機24架，獵食者無人機45架，ev22電子戰旋翼機3架，“標槍”反坦克導彈發射裝置108部，155毫米777超輕型榴彈炮72門，90毫米無坐力炮24門，107毫米迫擊炮60門，36部“復仇者”防空導彈系統和24門陸盾730高炮，各型無線電臺5281部，各種夜視裝置4657部，40毫米203榴彈發射器999具，9型裝甲戰鬥工程車8輛。
東輝海軍陸戰隊騎二師，隸屬於東輝海軍陸戰隊第二遠征部隊。是印度洋艦隊陸戰隊機動突擊部隊，也是東輝戰略預備隊主力師。
全師編有人，下轄第2、第6、第8陸戰步兵團各轄一個司令部營、三個步兵營）和第13陸戰炮兵團轄三個炮兵營），以及第24陸航團，外加八個師屬營連司令部營、第2直升機偵察管、第2戰鬥工兵營、第2陸航大隊、第2警通營、第2防化連和第2憲兵連)。師武器裝備與海軍陸戰隊第1師相同。
東輝海軍陸戰隊騎三師，隸屬於東輝海軍陸戰隊第三遠征部隊，是大西洋艦隊陸戰隊機動突擊部隊，全師編有人，下轄第3、第4、第9陸戰步兵團各轄一個司令部營、三個步兵營）和第15陸戰炮兵團轄四個炮兵營），第26陸航團以及師屬營連八個司令部營、第3直升機偵察管、第3戰鬥工兵營、第3陸航中隊、第3警通營、第3防化連和第3憲連連)。師武器裝備與海軍陸戰隊第1師相同。
東輝海軍陸戰隊騎五師，隸屬於東輝海軍陸戰隊第五遠征部隊，是地中海艦隊陸戰隊機動突擊部隊，全師編有人，下轄第10、第11、第12陸戰步兵團各轄一個司令部營和三個步兵營)和第16陸戰炮兵團轄四個炮兵營)，師直屬營6個司令部營、第5直升機偵察管、第5戰鬥工兵營、第5陸航中隊和第5通訊營）。全師武器裝備與海軍陸戰隊第1師相同。
東輝海軍陸戰隊第四師，作為預備役師，該師計劃駐紮在曙光島本土。
目前，不僅五個陸戰師已經全部滿編滿員，包括配屬給遠征打擊部隊的五個航空兵聯隊、五個勤務支援大隊以及五支特種兵大隊也都是齊裝滿員。
也就是說，程功現在手裡能動用的陸戰遠征打擊部隊已經將近三十五萬人馬。但這並不包括海軍九大艦隊、十二個艦載機航空聯隊以及東輝空軍空中作戰司令部轄下的五個航空隊、24個飛行聯隊和空中機動司令部轄下的二個航空隊和15個飛行聯隊在內。
如果全部加起來，程功掌控的總兵力將達到130萬人之多。只不過現在兵員缺口還非常大，海軍和空軍人員嚴重不足，暫時只能先把陸戰部隊湊滿了，將新幾內亞島給統一了再說。
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