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小朋友和家長聽到後都看向柯南，柯南按了一下鞋子上的按鈕將遙控器踢向飛機，飛機在空中炸了。人們看到後紛紛逃跑。這時柯南的手機響了，是小黑打來的。
商城裡，小蘭青子園子在商城裡找了個餐廳點了一些點心順便在這裡休息。突然青子的手機響了，青子看了一眼來電人走到廁所去接的。
“柯南？”青子開口。
“你和蘭還有園子在一起吧？你們現在在哪！”柯南焦急地喊著，旁邊還有風聲，似乎在騎滑板。
“我們在米花電影城附近的大商場裡啊，怎麼了？”青子疑惑。
“快通知那裡的人離開！那個商城裡有些炸彈！”柯南吼道。
“什麼！”青子驚訝趕緊掛掉電話通知餐廳裡的服務生讓她找經理。小蘭和園子一臉納悶地過來“青子，怎麼了？”
青子緊皺著眉頭“剛剛工藤新一給我打電話，說這裡有炸彈，趕緊疏散人群。”
“新一？”小蘭略微驚訝。園子一臉不相信但是因為是新一說的也只好相信。青子跟餐廳經理說了事情以後，經理一開始不相信，但被青子吼了一頓“寧可信其有不可信其無，難道你要用這個商城裡所有人的性命做賭注嗎！”聽青子這麼一說經理這才慌忙去通知商城裡的高層，然後廣播疏散人群。
人群散盡，警察也來圍上了警戒線。目暮警官跟著經理找到青子“就是這位小姑娘告訴我有炸彈的。”
目暮警官看到是小蘭青子園子後有些驚訝“這是真的嗎？”
青子看向目暮警官“新一的話，應該沒有錯。”
目暮警官皺著眉點點頭，抬頭看著大商城。看來新一在目暮警官心裡的信任值100分啊！青子心想。
就在人們毫無防備之時，大商城一樓突然爆炸，原本看熱鬧的人們立刻倉皇逃走。最後大商城幾乎被毀，目暮警官也很驚訝“青子，新一說誰是犯人了嗎？”
青子搖搖頭，然後突然掃到不遠處賣電視機的地方播著新聞：一位小男孩被炸彈炸傷，原因正在調查。
這時目暮警官也接到了電話，然後交代了佐藤警官一些事後就走向警車。青子見此立刻跟小蘭園子打了聲招呼就跟了上去。跟著上車後，目暮警官驚訝地看著青子“你怎麼也上來了？”
“你是要去醫院找受傷的柯南吧？我也去。”青子回答。
“你怎麼知道……”
“剛剛遠處的電視機有播新聞，然後你又接到電話了，我猜的。”青子說。目暮警官只好帶著青子一起去。車上，青子一直在思考這應該是劇場版一的劇情，但是她並不記得有炸大商城的內容啊！倒是有炸摩天樓大廈的內容。這次的不同加上上次百貨公司屋頂沒有籃球那次，已經兩次不同了，難道這裡發生的事會隨時改變？！
到了醫院後，青子跟著目暮警官找到病房進去。柯南頭被紗布圍了好幾圈，此時已經醒了，坐在床邊挨毛利大叔的訓，阿笠博士也在這裡。
“真是的！就知道做這些危險的事！”毛利大叔訓道。目暮警官立刻上前當好人“好了好了，柯南這也算立功了。柯南，你見到犯人了嗎？”
“沒有。不過他就是之前偷炸藥的那個人！”柯南用孩子語氣說。
“現在已經炸了一個商城了，加上柯南帶到曠地上爆炸的那個，這炸藥數量遠遠不夠他偷走的。”目暮警官皺眉。說到商城爆炸，柯南立刻看向青子。青子秒懂柯南眼神的意思，笑道“不過多虧了新一，商城爆炸才沒有人員傷亡。”
“是啊。”目暮警官贊同。聽到這句話柯南略微鬆了口氣。柯南的手機這時候響了，大家立刻注意力都在柯南手機上。目暮警官看著柯南“如果是犯人你就把電話交給毛利。”
“嗯！”柯南乖巧地回答，然後接通電話，對面果然傳來小黑的聲音。柯南按下擴音，小黑得意地笑了一下“兩枚炸彈都被你找到了，不愧是工藤新一選的人。接下來有五枚炸彈在新幹線上，如果列車時速低於60就會爆炸，太陽落山時如果還沒找到炸彈，那麼也會爆炸。”
“什麼！”所有人聽到都震驚了。毛利大叔和目暮警官趕緊跑出去坐警車去新幹線那裡，房間裡剩下柯南，阿笠博士和青子。柯南坐在床上沉思炸彈的位置，阿笠博士出去搬了個小電視到柯南的病房裡，青子站在窗邊看著外面。這時候毛利大叔和目暮警官應該已經到新幹線總部了，每輛列車也不在任何站停下時速保持在70以上。青子看了太陽緩緩落下，一直忍著沒告訴柯南炸彈爆炸的原因，因為這一定要他自己思考出來。
電視上新聞報道著新幹線不停下的事件，並詢問工作人員原因，但都沒給答複。柯南皺著眉看著新聞，努力思考著。阿笠博士走到窗前給柯南倒水喝，看著外面的太陽“太陽就要落山了呢。”
“是啊，太陽落山了，就曬不到陽光了呢。”青子提示道。柯南聽到後恍然大悟，陽光？車速？原來如此，我懂了！然後立刻拿起電話利用蝴蝶結變聲器打給還在新幹線總部的目暮警官“目暮警官，炸彈埋放的位置我已經知道了。”
“真的嗎！新一！”目暮警官立刻驚喜地喊出來。柯南點點頭“炸彈如果在幾秒內照射不到陽光就會爆炸，所以炸彈一定在一直有陽光的地方，只要電車……”聽著柯南說出推理過程，青子笑了出來，這個炸彈解決了，應該就剩摩天樓大廈了吧？想到這裡青子拿出手機準備打電話給小蘭想讓她換個地方去看電影，但是突然想起最後有一枚炸彈是小蘭拆的，如果小蘭不在那座大廈裡，炸彈會爆炸的！青子猶豫地看著電話，怎麼辦……
柯南打完電話，自信地笑著，突然看到想事情想出神的青子“青子？”
“嗯？”青子回過神來看著柯南。
“你有什麼事嗎？”柯南疑惑地問。
“嗯……是有點事呢，我就不陪你啦，先回去了。”青子笑道，然後拎著袋子走了。柯南一臉懵逼地看著青子走出去。阿笠博士揹著手站在柯南床邊“很奇怪的一個女孩呢。”
