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綾波麗是一個人造人，或者說是克隆人，她的靈魂來自莉莉絲，而構成她身體的dna則來自碇唯。這也是為什麼，真嗣總能從麗的身上看到他母親的影子。
之前，李曉就一直在猶豫要不要把麗的真正身份告訴真嗣和明日香，後來李曉覺得他不能代替麗做這個決定，還是讓麗自己來抉擇吧，而麗最後選擇說出了真相。
麗說完後，真嗣和明日香驚訝的目瞪口呆，在一起相處了這麼久的朋友、戰友竟然是人造人，這任誰一時半會都不能反應過來。
李曉擔心真嗣和明日香接受不了麗的真正身份，趕忙在旁邊打著圓場說:“真嗣，明日香，你們不要多想，雖然麗的出身有些特別，但是麗依舊是麗，這一點永遠都不會改變的。”
在最初的驚訝過後，明日香漸漸冷靜下來，她雙手一抱膀，滿不在乎的說:“我是覺得沒什麼，對我來講，英雄不問出處。”
明日香說完，李曉扭頭看向真嗣:“真嗣你呢？”
明日香的反應其實是在李曉的預料之中，他真正擔心的是真嗣不能接受麗，一來真嗣的性格就是那麼別扭；二來對麗來說，真嗣比明日香更重要。明日香如果拒絕麗可能沒什麼，但是如果被真嗣拒絕，那麼麗一定會非常傷心的。
真嗣的臉上帶著糾結的表情，他低著頭思索了好一會兒，然後慢慢抬起頭，一臉迷茫的慢慢說:“綾波是我母親的克隆人，那豈不是說……綾波就是我的母親！”
聽完真嗣這番腦洞大開的聯想，李曉差點沒一頭栽地上，他無語的一巴掌拍在真嗣腦門上，跳著腳沖他吼道:“合著你半天就在糾結這玩意那？我說你平常的腦迴路也沒這麼歡脫啊？你就不能把麗想象成你的姐姐或者妹妹？七大姑八大姨也行啊！”
明日香在旁邊斜了李曉一眼:“真嗣這歡脫的腦迴路還不是讓你帶的？”
真嗣捂著腦門，委屈的說:“綾波是人造人我雖然很吃驚，但也覺得沒什麼。只是，知道綾波使用的是我母親的dna，再看綾波的時候就總覺得特別別扭，總有一種想叫她媽的沖動。”
這時候，麗忽然在一旁悠悠的來了一句:“如果碇君喜歡的話，我不介意。”
李曉:“……”
明日香:“……”
李曉發現麗真是一般不開口，開口不一般，隨隨便便一句話就能把人噎死。
李曉大大咧咧的一拍真嗣肩膀:“以後對麗好一點吧，她體內可留著你媽的血呢。”
真嗣頓時跟吃了黃蓮似的，一臉苦味:“你這麼說我覺得更別扭了。”
總之，綾波麗的身份就這樣在一番腦洞大開的吵吵鬧鬧後被真嗣和明日香接受了。
現在，量産機也打敗了，綾波麗也留下來了，一切都與李曉的“劇本”一樣，最後皆大歡喜。至於，之後如何與政府和聯合國談判，如何揭露seee的陰謀，這些事情李曉就懶得操心了，自有碇司令和冬月副司令處理。就算最後與聯合國談不攏李曉也不在乎，大不了就接著打唄，生死看淡，不服就幹，出門在外，三分天註定，七分靠打拼，剩下的九十分全靠莽！
李曉四個人又瞎扯了幾句就要離開最終教條區了，麗換上她萬年不變的校服，臨走的時候，李曉看見麗一個人站在一旁，仰著頭呆呆的看著莉莉絲，不知道在想些什麼，她的眼神中充滿了悲傷。
李曉走過去，來到麗的身旁，小心翼翼的問:“麗，莉莉絲以後怎麼辦？”
