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東方玉和設計師這邊的事情暫且不論，趁著東方玉進入了設計師所在的源頭，正在和設計師談話的時候，也是國家機器的力量和母體之間相互對立糾纏住了的時候，尼奧等人已經成功的沖到了墨菲斯被關押的地方了，開始想辦法智取，將墨菲斯救出來。Ω e小 Δ說
這個時候，母體的注意力，幾乎都被東方玉和國家機器的力量所吸引了，所以對尼奧等人來說，這絕對是救下墨菲斯千載難逢的機會。
不過，那個留下來的特工史密斯，顯然也不是善茬，亦或者說他也存在著其他的秘密，所以相對於別的電腦特工，他在墨菲斯身上花的心思更多。
雖然尼奧等人已經是盡量的想辦法智取了，不過，他們的計劃卻還是被史密斯所識破了，到了最後，依舊是演變成了電腦特工和尼奧等人之間的戰鬥。
駭客帝國的位面，人類和機器人之間的戰鬥，最根本的原因還在於一點，那就是擁有了追求和欲·望的人工智慧，便相當於完整的靈魂了，所以，這個位面的人類和機器人才會出現戰爭，而史密斯，同樣如此。
不同於其他的電腦特工，史密斯的追求就是自由，他早已厭倦了在母體的作用下四處奔命的生活了，同樣的，這矩陣的虛擬世界，在史密斯看來簡直就像是一座監獄，所以史密斯也有自己的小心思，那就是獲得錫安的密碼，然後脫離母體的掌控，甚至離開矩陣這個虛擬的是世界。
言歸正傳，當史密斯識破了尼奧等人的計謀之後，試問將墨菲斯腦海中錫安的密碼視作自己通往自由的鑰匙的史密斯，又如何會輕易的讓他們逃離呢？
所以，一場大戰是在所難免了。
雖然史密斯只有獨自一人，但是電腦特工的程式，不管是在力量還是敏捷，甚至是很多的方面都是淩駕於人類之上的，甚至是以史密斯的度，連子彈都能夠躲開，試問這些人又如何會是他的對手？
尼奧等人救下了墨菲斯，正準備暗中逃跑，但是史密斯反應過來，已經追上了他們了，拳腳之間的戰鬥，沒人是史密斯的對手，崔妮蒂，艾帕克，甚至是尼奧都敗在史密斯的手中了……
“哦。墨菲斯先生，你們不能就這樣離開，我的夢想還沒有實現呢”，一舉將尼奧他們全部都打敗了之後，史密斯特工臉上掛著笑意。
抓著墨菲斯胸口的衣襟，旋即史密斯的臉色一變，目露兇光，惡狠狠的模樣，道：“好了，墨菲斯先生，不要再浪費我的時間了，我的耐心已經快要被你消磨趕緊了，說吧，告訴我吧，進入錫安的密碼究竟是什麼？”。
“不能說，墨菲斯，不能告訴他……”，被史密斯擊倒了，艾帕克躺在地上，嘴裡吐著鮮血，一邊開口說道。
已經服下了史密斯逼供所用的藥物很久了，那是能夠入侵腦海的藥物，艾帕克還真怕墨菲斯支撐不住，要知道，錫安的密碼那可關繫著千千萬萬最後的倖存者的生命呢。
“哦，不不不，艾帕克先生，我們兩個人說話的時候，希望你可別插嘴”，對於艾帕克插嘴的話語，史密斯自然是很不滿意了，聞言搖搖頭的說道。
說話間史密斯的槍口指向了艾帕克，在尼奧等人的驚叫聲中開槍了，子彈直接射到了艾帕克的身上，讓他住嘴了。
“好吧，墨菲斯先生，我真的已經沒有耐心了，快告訴我錫安的密碼，快，不然，我要當著你的面，將他們一個個全都殺死”，一直以來看起來都謙遜有禮模樣的史密斯，這一刻就像是終於厭倦了偽裝似的，撕下了自己虛偽的面具，惡狠狠的一把揪住了墨菲斯的頭，開口說道。
槍口又指向了同樣躺在地上動彈不得的崔妮蒂。
被史密斯狠狠的揪住了頭，墨菲斯的眼神一片茫然，嘴唇幾度張開，都想要開口說話，盡管墨菲斯的心智早已堅硬如鐵了，可是在那藥物之下堅持了這麼久，墨菲斯也早就達到了極限了，看他的模樣，也已經完全支撐不了多久了。
“不能說，墨菲斯，不能告訴他……”，尼奧的心下也在大聲的吶喊著，只是同樣受了傷，胸口的肋骨都被打斷了兩根，尼奧就算是想要站起來反抗，都已經是心有餘而力不足了。
崔妮蒂看著指向自己的槍口，黑黝黝的槍口讓她覺得恐懼，但是想到錫安那麼多的民眾，崔妮蒂的神色又變得決然了。
“好吧，看來這些同伴在墨菲斯先生你的眼中也不是那麼重要啊”，看著墨菲斯依舊是沒有開口的意思，史密斯的目光中帶著森冷之色，沒有絲毫憐憫和遲疑的樣子，毫不客氣的對著崔妮蒂就是一槍下去。
銳利的子彈直接射入了崔妮蒂的胸腹之中，讓崔妮蒂都忍不住慘叫出聲。
