神奇口袋中的寶貝簡稱神奇寶貝。
是這個叫“神奇寶貝”世界裡的一種神奇生物。
並且是一種非常非常不可思議的生物，其種類有……100、200、300、400……不，可能更多也說不定。
不管是在陸地上奔跑的、海洋裡暢遊的、天空中翺翔的、森林裡棲息的、火山中咆哮的、雪山中前行的、城市裡嬉戲的……在世界上的各種地方都可以見到他們的身影。
人和神奇寶貝會以成為神奇寶貝對戰這項競賽的冠軍為目標，彼此同心協力並肩作戰；會以朋友的身份、夥伴的身份，彼此心意相同，一起共同生活……
有多少神奇寶貝就有多少個夢想，有多少神奇寶貝就有多少邂逅，有多少神奇寶貝就有多少次冒險在等著你……
……
而這個故事，要從這裡開始……
……
在神奇寶貝世界的一個扭曲的時空夾縫之中，這個地方，時間與空間在互相碰撞，“空空空......”時不時傳來一陣陣氣場，住在裂縫中的未知圖騰四處逃跑，怒氣籠罩了這個時空夾縫，而這怒氣來源於兩只神奇寶貝身上。
“唲~！”
一隻蜷曲著的大型紫色神奇寶貝吼叫著，在它的周圍空間在不斷的扭曲著形成一個個黑洞。
“啊！”
而在它的對面是一隻藍色的大型神奇寶貝，它的周圍時間破碎，有過去、有現在、也有未來。
它們在這裡激戰了很久很久，不知道碰撞了多少次已經不知道過了多久它們的體力快不行了，全身已是遍體鱗傷，它們決定現在要以一招定勝負，各自用出了大招。紫色精靈的手臂上那珍珠在閃耀著，它在手上凝聚了出了一團粉色能量，手一揮，劃出一道散發著空間能量的粉色彎月沖向藍色精靈，藍色精靈胸口的鑽石也在閃耀，它從嘴裡射出一道充滿著時間能量的能量柱。
“轟~”
兩股強大的能量碰撞在一起，周圍的空間、時間彷彿破碎了似的…………
……
在浩瀚宇宙中的某個地方，有著一片奇異的地方，在這裡一切皆是虛無，這時，在這裡響起了一個無上聲音：“你感受到了嗎？”
另一個無上聲音回答道：“嗯！時空錯亂，亂世將至，群雄四起，又是一場風雲。”
……
在一個昏暗的房間裡，一位正在床上用gba遊戲機玩口袋妖怪的少年。“乎～，終於抓到你了。”少年道。這位少年叫阿桂，是一個剛上初中的學生，他從小就很喜歡神奇寶貝，也喜歡玩神奇寶貝的遊戲——口袋妖怪。阿桂現在是個孤兒，父親和母親在阿桂還上小學的時候就去世了。阿桂對於父親和母親的記憶很模糊，只是記得父親很愛吃肉，母親最拿手一道炒肉。
阿桂放下手中沒電的gba遊戲機，連線上gba遊戲機的充電器，站起身來看向窗外，他才發現現在已是深夜，窗外下著大雨，天空上時不時劈過幾道閃電。
“轟！”
突然，剎那間，一道閃電破壞了窗戶擊穿阿桂的心髒，在這一瞬間他並沒有驚訝為什麼自己死了，而是純粹的看著窗戶玻璃破碎和擊穿自己心髒的閃電什麼也沒想，因為眼前的景象已經美到無法想象的地步了。
實際上也的確想象不了，因為眼睛被閃電的強光失去了光明，那美麗的景象不過是腦中閃現的情景罷了，耳朵也被巨大的轟隆聲震得“嗡嗡嗡”響，身體失去了知覺，精神變得恍惚，感覺自己正被吸進一個深不見底的黑洞裡，這裡面，像一條長長的隧道，阿桂在嘶吼著，阿桂感覺得到自己的身體在不斷的變小，變小，終於，身體消失了，只剩下了一個靈魂在飄蕩著，自己就像不存在一樣，在這長長的隧道飄著，也不知道飄了多久，也不知道飄到了哪，在他的背後出現了升起一道幽紫色光芒，光芒照耀在阿桂的靈魂上，靈魂彷彿在閃耀著銀光，這時在靈魂的左胸處，亮起了金色的光芒，這是心靈的金色，最終這光芒把阿桂吞沒，阿桂也完全昏了過去，這光芒包裹著阿桂並和其一起消散......
......
“啊，啊……啊……”在一個小鎮上，傳來一陣陣女人的嘶吼聲，這並不是痛苦的嘶吼，而是努力的嘶吼，是一個生命誕生的前兆。
女人吼叫了一會，最終平息下來了，但是這個女人還是大聲的喘著氣，這時，一個男人高興的抱著這個新生的生命說道：“生了，生了，是個男孩！太好了！”
男人抱著小嬰兒跑出家門，看著家門前那棵開著黃色的花兒桂花樹，聞著空氣中從桂花樹上帶來的清香。
男人看了看桂花樹，又看了看在懷中熟睡的小嬰兒……
那個女人坐在床頭，開啟了床邊的窗戶，她看著那桂花樹和聞著桂花香，全身舒服了不少，然後，又看向了抱在男人懷裡的小嬰兒……
“他的名字就叫……”男人和女人同時說道，他們都知道對方想說什麼。
