張秉貞、王毅二人在杭州城捉拿鄭家的猛將甘輝，方原也在紹興府開始調動兵馬，準備支援杭州府，一舉攻破在杭州府至少據守了大半年的鄭森。
景傑南下追擊倭寇帶去了一萬玄甲鐵騎，一萬步戰營軍士；‘赤古臺在湖州府牽制鄭森的是五千玄甲鐵騎；如今留守在紹興府的，只有三千玄甲鐵騎，一萬步戰營軍士。這些軍士裡至少一半是剛剛從河南、江西帶回來的新卒，戰力比之老兵要弱了不少。而且還要防備金華府鄭芝龍的鄭兵。
方原估算了一下，能抽調前去杭州府的，不超過八千人。
單是方原這一路進攻，恐怕無法給予鄭森致命的一擊，方原立刻派人前去聯絡湖州府的赤古臺，整軍備戰，準備殺入杭州府，強攻鄭森主力。
十日之後，方原終於接到了張秉堅、王毅派人送來的急報。
急報裡是一個好訊息，一個壞訊息。
好訊息是二人果是依照約定，率領三千杭州衛所的明軍襲擊了甘輝前來杭州府催糧的督糧隊。
壞訊息是因甘輝驍勇善戰，竟然在三千明軍的重重包圍中殺出了一條血路，逃去了杭州城外的鳳凰山上，據險死守。
這個甘輝是方原指名點姓要活捉的，王毅根本不敢大意，立刻派兵將鳳凰山腳圍了個水洩不通，縱然攻不上山，但也不能讓甘輝就這麼溜了。
方原捉拿甘輝的計劃只成功了一半，無奈之下，只能率軍前去策應杭州城的防衛。
鄭森見杭州府突然發難，也是措手不及，立刻派出軍隊前去杭州城。到了杭州城下，鄭森面臨著兩個選擇，其一是攻打圍困鳳凰山的明軍，替甘輝解圍；其二是直接攻打杭州城，先拿下杭州城。
鄭森思來想去，杭州城既然投降了方原，杭州府也必然守不住了。攻打鳳凰山的明軍，是勞軍費力。還不如在玄甲軍趕到之前先拿下杭州城，然後洗劫城中錢糧。
杭州城曾經是南宋的都城，所謂上有天堂下有蘇杭，杭州歷來就是江南與蘇州齊名的富庶之地。若能洗劫了杭州城內的官紳、富商，足以令鄭軍吃個飽，然後從容南撤。
鄭森放棄了攻打鳳凰山明軍的計劃，轉而實施攻打杭州城的計劃。
為了狙擊玄甲軍的支援，鄭森立刻令麾下的虎將周全斌的五千兵馬出杭州右衛，依著杭州府北河網密佈的地形結營，步步狙擊從湖州府南下的玄甲鐵騎；另一員虎將馮信率五千兵馬在杭州、紹興二府交界處的鳳凰山東南，據守錢塘江，狙擊方原的援軍。
鄭森自率僅餘的一萬五千鄭軍，從杭州衛傾巢而出，準備攻打杭州城。
鄭軍到了杭州城下，連使者也沒派程序，二話不說就開始攻城。
浙江巡撫張秉貞見鄭森的軍事目的，就是不惜一切代價的攻下杭州城，至於攻下杭州城的目的，已是昭然若揭。
杭州城眼下已是退無可退，唯一的生路就是死守杭州城，等待玄甲軍前來救援。
指揮使王毅前去追擊甘輝，已帶走了杭州城絕大部分的守衛力量。如今還留在杭州城的，只有兩千衛所兵。區區兩千人要防守偌大一個杭州城，顯然是杯水車薪。
所幸杭州城裡至少有一百萬百姓，張秉貞立刻組織了自告奮勇的五千精壯百姓，分發了武器，間雜著衛所的兩千明軍，開始登上杭州城的城門守衛。
杭州城共有七個城門，三個水門，七千守軍分散在十個城門，每個城門只有五百至一千人不等。面對一萬五千鄭軍專門突破一點的攻城，還是捉衿見肘。
