下午繼續開會，首先研究透過帝國憲法。經過長時間的醞釀，第一部帝國憲法草案已經出爐。
這部帝國憲法是一切帝國法律的母法，地位至關重要。它對帝國的政體、皇位的繼承、軍隊政府的組織、國民的權利義務、立法司法行政監察諸項權力的分立等關鍵內容，都做出了詳盡的規定。
會前，憲法草案已經發布至省一級官員，廣為徵求意見。在座諸位委員，也已經充分研究過憲法的條款，一致透過憲法草案，決定提交資政院，進入表決程式。
根據憲法，決定進一步改革軍政府。楊烜建號稱帝后，各項制度逐漸走上正軌。軍政府軍事色彩過於濃厚，受革命軍影響太大，有必要進行進一步的軍政分離。
軍政府將改稱為“國民政府”，全稱為“中華帝國國民政府”。此舉旨在契合帝國為民謀利的宗旨，表示帝國政府乃全體國民之政府。
國民政府行使行政權，以政務院為最高行政機構，以政務卿為政府首腦。
軍政府時期，政務卿由皇帝直接任命。改組為國民政府後，政務卿由皇帝提命，交由資政院表決。資政院透過後，政務卿可以提名各部部長、副部長人選，名單經皇帝審定後，提交資政院表決。
由此不難看出，帝國憲法提高了資政院的地位。資政院由勳貴階層、各省代表組成，類似於各國的上議院，或者貴族院。
有了憲法指導，帝國將落實君主立憲制，有利於促進政府的團結，凝聚更多的愛國力量。
東南的戰事基本結束，南京的局勢也早已穩定。軍政委員會決定，要求滯留廣州的軍政部門儘快遷往南京，確保於9月初全部遷至南京。
9月10日開始，所有部門必須全部在南京正常辦公。廣州不再保留中央部門，僅留一個善後辦公室處理個別事宜。
政務院是帝國中央政府，為進一步適應經濟社會發展，決定對政務院開展一番大刀闊斧的改革。
一、外交部職權進一步膨脹，成為政務院排序第一的部門。根據工作物件的不同，外交部下設了亞洲司、北美司、西歐司、南洋司等部門。
二、陸軍部與海軍部合併，稱為國防部，主管軍備工作。軍備工作是一個比較寬泛的概念，包括裝備、後勤、軍事教育、軍事法律、國防工程等。
在此之前，陸軍部、海軍部分設，彼此爭奪預算，暗中較勁，頗受時人詬病。國防部統管軍備工作，可以加強統籌，避免資源浪費，統一權衡陸軍、海軍兩大軍種的建設，是一件大有裨益的事。
至此，軍權分立基本完成，帝國軍事制度基本完善。
軍諮府管軍政，掌管人事大權，制定戰略計劃，隸屬於皇室內廷。總司令部管軍令，隸屬於革命軍，負責指揮打仗，根據軍諮府的戰略制定作戰計劃。國防部主管軍備，隸屬於國民政府政務院。
三大機關分工協作，分權制約，防止軍人專擅。總體上，軍諮府隸屬內廷，地位更加超然，權力更大。
三、單設一個警察部，主管全國警察工作。警察部門原本隸屬於民政部，稱為民政部警察司，負責打擊犯罪、維持治安、警備巡視等。
隨著各項制度走上正軌，警察部門的職權也越來越膨脹，包括巡視警備、維持交通、偵查犯罪、保護軍政要員、看管監獄、守護倉庫堤壩、保護稅卡等。
警察隊伍人數也不斷增加，其骨幹大多是革命軍退伍軍人。普通警察裡有很多綠營兵、衙役出身的人。
革命軍佔領東南沿海各省後，綠營兵成建制投降。革命軍留強汰弱，很多強壯的、思想積極的綠營兵被補充進入守備師、警察。
