經過第一階段雙方快速船隻的火箭對射，兩邊的第一陣列主力戰船趕到，開始了船頭紅夷大炮的對射。由於紅夷大炮分量過重，且後坐力巨大，即使是大福船這樣的主力戰船也只能在船頭安裝一門。
雙方的陣列線上都有二十艘左右的重型戰船，雙方的紅夷大炮對射在雙方的陣列中都激起巨大的水柱。偶然有炮彈擊中船甲板，造成巨大爆炸，有時一發炮彈恰好擊斷船桅杆，造成船上更大混亂。
之前使用火箭對射的雙方快速戰船此時用光了火箭，穿梭進了對方的重型戰艦之間，使用小型的佛郎機炮和噴筒射擊。重型船隻的船舷也伸出許多輕型武器，和這些深入敵陣的船隻對射。
海面上水柱在數十條大小船隻之間不斷被激起，白色煙霧帶著濃重的火藥味很快遮蓋了整個海面，能看到的只有船隻巨大的黑色身影、噴吐的大小火舌以及船隻爆炸引起的火光和爆炸聲。
一艘明軍水師的大福船靠上蓬萊的蓋倫帆船，兩船船舷相接，明軍船上的陸戰士兵紛紛跳上敵船，展開肉搏戰。蓬萊士兵用火銃和裝滿鐵砂、碎石子的小炮掃射大群湧來的敵人，無奈明軍雖然有數十人被打倒，剩下的人卻不畏生死，前僕後繼地沖上來肉搏。
雙方在甲板上短兵相接，蓬萊軍很快就發現，自己在肉搏方面顯然不是明朝正規軍的對手，眼看甲板要被敵人壓制，明軍的大福船卻突然發生爆炸。蓬萊計程車兵們頓時歡呼雀躍，明軍心懷恐懼，只見一艘白色的獅頭船朝著明船直撲過來。獅子嘴裡的大炮噴出火焰，明軍大福船再次中彈發生爆炸，在蓬萊船上的明軍失去鬥志，有的被反攻的蓬萊軍殺死，有的跳海逃走。
判官郎君的狻猊船帶著船隊朝著明軍船陣沖擊，明船被他強大的火力和迅猛的突擊逼得連連後退，好幾艘船隻被擊毀。前線的蓬萊船隻受到鼓舞，也都展開反擊，眼看明軍的第一陣列被打得七零八落，不遠處又一排明船用炮火開路沖過來，補上前方的空缺。
海面上，上百艘船隻拖著長長的白色航跡廝殺，炮火像冰雹一樣砸向對方船隻。
判官郎君顯然是想再次突破明軍船陣，直達鄭提督的寶船，報斷手之仇。可當明軍第三波戰艦戰列線趕到時，他意識到敵人的陣型極其厚重。
在座船上的破軍更早地意識到了這點，他熟悉鄭提督的作戰方式。遠遠看去，只見鄭提督將超過自己幾倍的重型戰艦排成了十道戰列線，一層層地朝著前線壓過來。明顯可以看出，判官郎君在突破到第三層時，已然失去鋒銳，漸漸陷入和敵人的纏鬥中，鄭提督顯然就是要用這樣的方法拖蓬萊軍進入消耗戰。
建文看到破軍的臉上漸漸有了陰霾，他讓老何命令判官郎君開始撤退。
當前線的蓬萊船隻看到主帥的命令後退時，戰鬥進行了將近一小時，他們折損的船隻已超過三分之一，明軍的損失比他們略多，但對方損失得起。此時海上已然有許多船隻在沉沒，有的才沉了一半，有的只剩下桅杆還露出水面，海上漂浮著難以計數的破木板。判官郎君命令所有船隻緩緩後退，盡量和明船拉開距離，蓬萊的船隻躲避著船隻殘骸，邊開炮邊後退，並盡量將落水的友軍拉上船。
明軍步步緊逼，似乎並不想讓蓬萊軍撤出他們的射程，雙方的船頭似乎是粘在了一起。恰在此時，被破軍派出從兩翼包抄的兩支快速機動部隊發揮了作用，它們從兩側炮擊挺進的明軍，造成了明軍的遲滯和小混亂，前鋒的蓬萊船隊終於借機和明軍拉開距離。
“好機會！”
狻猊船上的判官郎君和破軍座船上的破軍、建文都精神一振，破軍立即命令老何向蓬萊炮臺方面發射訊號。
“嗵嗵嗵！”
三發紅色訊號炮發射上天，在高空炸出三朵紅色火花。這是引導蓬萊島的四門主炮開炮的訊號，從一開始，破軍就決定要在主炮射程內作戰，只需第一次齊射，就足夠葬送明軍水師的鬥志。判官郎君的出擊，也僅僅是誘敵深入的作戰，只要將敵人引進主炮射程，蓬萊軍勝利了一半。
三發訊號彈形成的火花逐漸在空中熄滅，變成三朵煙雲，很快彌散開。破軍期待已久的那四聲炸裂長空的炮聲並未響起。
“發生了什麼？”破軍心頭閃過不祥的預感，他緊緊握住腰間的寶劍巨闕。
又過了好一會兒，蓬萊方面依舊沒有任何動靜。明軍似乎從未擔心過昨日打得他們心驚膽戰的巨炮會發揮威力，排成十條戰列線的龐大陣形，一波波地邊開火邊朝著判官郎君的前線壓過來。破軍只好命令全軍停止後退，後退中的前鋒部隊撞到後線巋然不動的主力船隊，只好再次向前沖鋒。
明軍和蓬萊軍再次絞殺在一起，經過一輪炮擊，雙方船隻靠近，士兵們用小炮和火銃對射。趁著一輪射擊造成的煙霧，判官郎君帶著一群勇敢的投槍手，跳上敵人甲板，展開白刃戰。他雖然失去右手，但單憑左手依舊能將一把沉重的斬馬刀使得如同草棍般輕巧。
轉瞬間，他砍倒了十幾名明軍，一個明軍的遊擊抽出兩把雪花鋼刀，舞得花團錦簇般尋他單挑。判官郎君“呸”地將嘴裡混著火藥煙的異物吐到甲板上，單手舞著斬馬刀迎上去。對面的遊擊武藝也不差，和判官郎君的單手斬馬刀居然打成平手，雙方交手三十幾個回合，判官郎君才瞅到一個空隙，一刀狠狠劈在對方頭盔上，將對方腦袋像劈西瓜那樣剁成兩半。跟隨他的標槍手士氣大振，發出“哦”的歡呼，將手中的標槍朝著敵軍拋去，剎那間又戳翻二十幾人。剩下的明軍抵擋不住，只好跳海逃命。
判官郎君扭頭望向破軍的主船，主船上帥旗和紅色的戰鬥旗高懸，激勵全軍突進鼓點絲毫沒有減弱的意思，老何手裡那面大令旗也還在左右飄動。知道現在除了硬碰硬的戰鬥沒有別的辦法，判官郎君跳回狻猊船，又朝著另一艘明軍船駛去。
寶船上的鄭提督也在緊緊注視著眼前的戰局發展，一夜激戰在甲板上留下的血跡早已被擦洗幹淨，血腥味也被海風吹散。他站在船頭，觀察著破軍方面的動靜。現在，他的船隊佔有絕對優勢，這優勢不光是數量上的，也在於他對數量優勢的良好運用。
早在判官郎君的突襲前，他就已經計劃好將水師的近四百艘船分成三部分，一百艘交給王參將帶領的左翼，一百艘交給監軍率領的右翼，自己率領剩下的大約二百艘船為中軍，吸引破軍的主力正面對決。
他早猜到處於劣勢的破軍肯定會採用誘敵深入的戰術，以前鋒為誘餌將明軍引入射程，用蓬萊的巨炮轟擊後，再趁著混亂全軍突擊——這其實也是破軍唯一的選擇。王參將的左翼遊擊船隊早就脫離主隊，迂迴到了蓬萊島發動攻擊。破軍的兵力捉襟見肘，本島完全沒留下駐留艦隊，四門主炮又必須用來對付鄭提督的中軍，自然只能用要塞炮還擊。王參將纏住蓬萊島，懼怕後方有失的破軍唯有回師救援，但自己的中軍絕不會放他退出戰線，右翼的一百艘船將在最後時刻作為總預備隊投入。
現在，前方戰局完全依照他的初始戰略順利進行著，他甚至組織了俘虜船去撈起落水的蓬萊水兵，以免幹得太過趕盡殺絕，以後讓人說自己做事太絕。
此時，鄭提督清楚看到青龍船帶著十幾艘船轉頭快速脫離了破軍的座船，他猜到這是建文帶著少量船隻去救援蓬萊。破軍船頭的令旗還在揮舞，身穿紅色戰袍的破軍身影也依稀可見。以建文生澀的統帥才能，要想對抗王參將的左翼一百艘船，只怕不過是杯水車薪。
“戰爭能勝到七分就行，不必追求所謂全勝，何況這也非我所願。”鄭提督眯著細長的雙眼，望著遠處高聳在蓬萊船隊裡異常顯眼的破軍座船，然後對身邊的中軍下令，“讓後方待命的三波船隻也都壓上去，不要給蓬萊叛軍喘息之機。”
王參將的船隊昨晚即出發，在海上兜了好大一個圈子，直到早上破軍的主力到達前線後才出現在蓬萊島。由於他出發太早，甚至都不知道判官郎君夜襲寶船，和鄭提督對決的事。當蓬萊島炮臺上計程車兵們看到月牙白的明軍船出現在近海，造成的慌亂可想而知。
此時的蓬萊島不但沒有一艘駐留戰船，甚至做不到所有炮臺上都能配備足夠人數操縱岸防火炮。除去四門主炮的炮手，最好的炮手都被破軍帶走，現在炮臺守衛的只是充數的輜重兵和工兵罷了。
