神武門門前，九名身材高壯的千牛衛校尉，手中甩鞭擊地，奏樂聲遂止，馬晉斂服端坐在御座之上，一旁王承恩等大小太監，皆手執拂塵垂首靜立。
隨後，全體文武官員，面向神武門，跪拜四次，山呼萬歲。
此時，有禮部官員上前，在神武門前中道位置，向城樓上大聲跪奏道:
“陛下！叛軍之中六品以上官員計八百二十七人業已帶到，皆已查明正身，點驗無誤，恭請陛下聖裁！”
這名官員將最後恭請聖裁四字說得又重又長，話音剛落，全體平叛大軍與一眾官員，又高呼了三聲萬歲。
“此等逆賊，忘恩負義，荼毒州郡，侵害百姓，實是罪行深重，斷無可恕！其中首要之徒馬琳、陳挺等立時押解街市，凌遲處死，除馬琳外，夷三族！其餘附逆等眾，滿門抄斬，以儆效尤！”
馬俊威嚴的聲音，在神武門城樓上高高響起完畢後，平叛大軍與一眾官員又高呼了三聲萬歲。
俘虜們押下去後，文武百官唱排班，致詞賦，跪道而頌，賀訖，樂聲又大作，眾人五拜三叩頭，最後平身樂止，禮部官員跪奏禮畢，樂興，馬晉御駕迴轉宮中，獻俘儀式，到此正式結束了。
翌日，馬晉頒旨大赦天下。
封樞密使謝玄為弋陽伯，賜金書鐵券。
等樞密副使岳飛為鄴城伯，賜金書鐵卷。
封岳雲為控鶴軍大統領
……
同時又下旨將這兩日召喚出來的人傑授予要職，替他安撫朝堂，分守地方。
授寇準為文淵閣大學士、入值內閣，參與機務。
授李存孝為左豹韜衛大將軍、幷州都督，率左豹韜衛主力往鎮幷州。
……
同時挾大勝之威，下嚴旨令在外駐防的朝廷八衛大將軍回京述職。他打算將朝廷的十六衛加以整編，縮編為十二衛、只保留羽林衛、龍武衛、龍驤衛、豹韜衛、鷹揚衛、武侯衛，整編以後十二衛輪番出鎮地方，以威懾天下，鎮壓不臣。
依照先前所議，十二衛每衛增編至二萬四千人，下轄二十四個都尉營，衛設大將軍一人，正三品銜；設將軍兩人，正四品銜；由三人分統本衛兵馬，此十二衛兵馬直接向皇帝負責，稱“御前禁軍”。
皇宮宿衛職責由千牛衛兵馬和十二衛輪值兵馬共同負責，內衛府派遣內衛為軍中鎮撫，監察軍旅，以防不測。
千牛衛為“宿衛禁軍”，仍專司皇城大內宿衛巡防、宮禁等事，轄衛士一萬二千人。
騰驤衛番號歸於御馬監，由御馬監諸營編為左、右騰驤衛，編制兵馬各一萬二千人。
改革地方軍制，打破地域束縛，十三州衛以後由朝廷一體統轄，不受地方巡撫管制，每州設衛將軍一名，從三品。地方衛軍四年換防一次，旨在加強中央集權，削弱地方影響，為他以後的變法做準備。
